Nat Genet： 人类癌症中病毒产于

柏林乳小叶癌数据分析所 Peter Lichter 团队最新数据分析探索了有机体乳小叶癌中都菌株的特有种。日前《自然现象—生物学》在线发表了这一成果。

作为泛癌全部都是基因第三组分析三巨头的一部分，该统计数据库抽取了 38 个型式的 2658 例乳小叶癌样本的全部都是基因第三组和一部分转录全部都是基因第三组脱氧核糖核酸统计数据，数据分析人员利用共识的原理，导入了 3 个统一统计数据库来作全部都是面性数据分析潜在的菌株免疫。在 382 个基因第三组和 68 个转录第三组统计数据集中都都探测到了菌株普遍存在。数据分析发现，已知的与之外的菌株，如西蒙—巴尔菌株（EBV）、乙型肝炎菌株（HBV）和人瘤菌株（HPV）的检出率都很极高。

这项数据分析揭示了下腹部癌中都 HPV 和驱动基因突变的显着实体以及 HPV 与 APOBEC 突变特征的之外性，这说明了抗菌株机动力下滑是宫颈癌、膀胱癌和下腹部癌的某种程度。对于 HBV、HPV16、HPV18 和小叶之外菌株 2，菌株导入与基因第三组拷贝数的局部波动有关。在 TERT 启动子处的导入与端粒酶的极高解读有关，从而明显激活了该的生殖全过程。介导逆转录菌株的极高解读与肾癌患者较差的生存期有关。

原始出处：

Zapatka， M.， Borozan， I.， Brewer， D.S. et al. The landscape of viral associations in human cancers. Nat Genet (2020). https：//doi.org/10.1038/s41588-019-0558-9.